토양환경 및 폐기물 연구실에서는 토양 및 폐기물의 특성을 평가하고, 오염토양 복원 및 유해폐물 처리 연구를 중점적으로 진행하고 있다. 또한 중금속 오염 지하수 처리와 관련하여 천연폐자원 바이오차 기반의 흡착재를 개발하는 연구도 진행히고 있다. 오염토양 복원 및 유해폐기물 처리 연구와 관련하여 천연 폐자원을 이용한 안정화 연구가 진행되고 있으며 또한 토양 세척 장비를 이용한 최적 조건 도출을 위한 오염토양 세척연구가 진행중이다. 토양, 폐기물 및 지하수 처리를 위해 친환경적이고 경제성이 우수한 전반적인 연구를 진행하고 있다.